Bei Erkrankungen des Gesichtsschädels, der Nasennebenhöhlen, des Rachens, der Speicheldrüsen und des Halses kann das MR herausfinden, wie ausgebreitet die Erkrankung ist und vor allen Dingen, ob es sich um einen gut- oder bösartigen Prozess handelt.
Praeoperative Untersuchungen der Zähne, der Nase und der Nasennebenhöhlen sind aufgrund der höheren Detailauflösung in den Knochen besser im CT als im MR zu untersuchen.
Die Darstellung des Gehirns und Rückenmarks ist seit mehr als 25 Jahren eine Domäne des MR, das heißt mit keiner anderen Untersuchung auch nur annähernd gleich gut durchführbar. Dieses gilt für jede Fragestellung zum Beispiel: Tumor, Entzündung, Durchblutungsstörung, Missbildung. Mit modernen Verfahren wie Diffusion, Perfusion und Spektroskopie kann Stellung genommen werden zum Energieverbrauch bestimmter Tumoren, zur molekularen Zusammensetzung von Strukturen oder deren architektonischen Aufbau. Dieses hilft, um zwischen Abszessen, Durchblutungsstörungen, gutartigen oder bösartigen Tumoren zu unterscheiden.
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